É sabido que o cromossomo X de mamíferos contém um número muito maior de genes que o cromossomo Y. Quando se tem fêmeas, ocorre um desbalanceamento dos genes ligado ao sexo entre machos e fêmeas. Por esse motivo, os mamíferos desenvolveram complexas estratégias para resolver o problema.
Segundo os pesquisadores Khanh Huynh e Jeannie Lee a inativação do cromossomo X pode estar envolvido com um mecanismo de defesa, muito antigo no genoma, para silenciar DNA que não está pareado. O trabalho “X-chromosome Inactivation: a hypothesis linking ontogeny and phylogeny” foi publicado na Nature Reviews Genetics de 06 de maio de 2005.